科學家解碼橄欖樹基因組

來自西班牙的一組科學家首次發表了橄欖樹的完整基因組。

Jun.30,2016
伊莎貝爾·普京賈

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來自基因組調控中心 (CRG)、Real Jardín Botánico (CSIC-RJB) 和 Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG) 的研究人員使用屬於西班牙人的具有 1,300 年曆史的標本解碼了橄欖樹基因組。法加品種作為參考。

在過去的 10 年中,許多植物物種的遺傳密碼已被組裝、註釋並公開。 現在可以將橄欖樹添加到已測序的植物基因組列表中。 這項為期三年的研究項目由西班牙銀行桑坦德銀行資助,並於 27 年 2016 月 - 日在開放數據期刊 GigaScience 上發表

該研究項目由 CSIC Real Jardín Botánico 的研究員 Pablo Vargas 協調,他在新聞稿中解釋了該過程:

基因組測序分為三個階段:首先,分離出我們兩年前發表的所有基因。 其次,組裝基因組,這是一個接一個地排列這些基因的問題,就像將一本書中鬆散的短語聯繫起來一樣。 最後,找出所有的基因,或者裝訂書。 後兩個階段是我們已經完成並正在呈現的。”

巴勃羅·巴爾加斯 (CSIC)

在橄欖樹基因的鑑定過程中,研究人員發現它擁有超過 56,000 個基因,遠遠超過其他植物物種,是人類基因組的兩倍。

研究人員還透露,通過使用具有 1,300 年曆史的橄欖樹標本,這是第一次使用如此古老的橄欖樹。 個體”已經對其基因組進行了測序。 到目前為止,所有被測序的個體,從果蠅 (Drosophila melanogaster) 到第一個被分析的人類,都已經活了一段時間,這取決於他們有限的預期壽命。 這是第一次對超過 1,000 歲的個體的 DNA 進行測序,並且可能會再活 1,300 年,”研究人員 Pablo Vargas 和 Toni Gabaldón (CRG) 透露。

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了解橄欖樹的遺傳密碼將有助於科學家了解與橄欖樹相關的各種因素,包括其壽命、對乾旱條件的適應性以及橄欖品種、大小和風味之間的差異。 最終,這也將促進對橄欖和橄欖油生產的基因改良以及如何保護橄欖樹免受細菌和感染的新研究。

為了促進進一步研究,橄欖樹基因組的完整測序已在 GigaScience 的公共領域提供 千兆數據庫.


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